พื้นที่สถานีวิจัยวนศาสตร์พังงามีลักษณะเป็นที่ค่อนข้างราบ มีเนินสูงต่ำอยู่บ้างเนื่องจากเป็นที่ดินเหมืองแร่ดีบุกเก่า ตอนบนของพื้นที่มีลำห้วยพรุใหญ่ไหลผ่านไปรวมกับคลองบางปอแล้วไหลออกสู่ทะเล ลำห้วยพรุใหญ่เป็นลำห้วยที่มีน้ำไหลเกือบตลอดทั้งปี ลักษณะดินเป็นดินลูกรังผสมทรายและกรวดที่มีความสมบูรณ์ค่อนข้างต่ำเพราะผ่านการทำเหมืองแร่ ดินชุดนี้มีปริมาณอาหารตามธรรมชาติต่ำ มักจะเกิดปัญหาการสูญเสียหน้าดินและการพังทลายของดิน และมีการแบ่งพื้นที่ตามลักษณะการจัดการ